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Seqino et la facture électronique : offre, limites, prix

publié le 21/08/2026· mis à jour le 17/08/2026· 10 min de lecture

Derrière Seqino, il y a une banque. Le Crédit Mutuel Arkéa a racheté cette solution de facturation électronique en avril 2025, quatre ans après sa création par Charles Foucque. La marque reste peu citée dans les comparatifs, alors qu’elle figure bien parmi les plateformes agréées immatriculées par la DGFiP. Ce décalage entre un adossement solide et une visibilité faible justifie de regarder ce qu’elle vend, et surtout à qui.

Premier point à clarifier : Seqino n’est pas un simple logiciel compatible. La société est immatriculée et apparaît sur la liste officielle des plateformes agréées tenue par l’administration. La distinction pèse lourd. Après le 1er septembre 2026, toutes les entreprises devront pouvoir recevoir leurs factures par une plateforme agréée, le portail public n’offrant plus de service gratuit d’émission et de réception.

Reste la question qui décide vraiment : ce positionnement correspond-il au vôtre ? L’éditeur ne publie aucune grille tarifaire et vend surtout par l’intermédiaire des cabinets comptables et des éditeurs de logiciels. Une TPE qui cherche un abonnement en libre-service tombera sur un formulaire de contact, pas sur un prix.

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Faire le diagnostic

Ce que Seqino vend, couche par couche

Trois briques composent l’offre, et elles ne s’adressent pas au même acheteur. Le logiciel de facturation vise l’entreprise, la plateforme agréée porte la conformité, l’API vise les éditeurs. Confondre les trois fait perdre des semaines en rendez-vous inutiles.

Un logiciel, une infrastructure, une API

Le logiciel couvre le cycle commercial courant : devis, bons de commande, factures, avoirs, relances par courriel et suivi des encaissements. L’éditeur y greffe un lien de paiement et un QR code, facturés 1 % par transaction, gratuits entre comptes Seqino. Une seconde brique traite les achats, avec lecture automatique des documents et pré-comptabilité poussée vers le cabinet. La troisième, la plus stratégique, est une API REST vendue en marque blanche ou en marque grise aux éditeurs de logiciels.

Ce que recouvre son statut de plateforme agréée

L’immatriculation relevée sur la liste DGFiP porte la date du 15 janvier 2026. L’éditeur, lui, communique sur un agrément obtenu dès septembre 2024. Les deux dates ne se contredisent pas : la procédure se déroule en deux temps, une immatriculation sous réserve d’abord, définitive ensuite, après réussite des tests d’interopérabilité. Seule la date de la liste officielle est opposable. Elle vaut trois ans, renouvelables.

Plateforme agréée· immatriculée le 15/01/2026· liste DGFiP au 12/08/2026

À qui Seqino parle, et à qui il ne parle pas

La cible affichée couvre les TPE, les PME et les ETI. Le canal de vente raconte pourtant autre chose : l’essentiel passe par les cabinets d’expertise comptable et par les éditeurs qui intègrent l’API. Cette différence entre cible marketing et canal réel décide de votre expérience d’achat.

Le cœur de cible : cabinets et éditeurs de logiciels

Un cabinet peut distribuer Seqino sous sa propre marque. À partir de septembre 2026, l’offre s’étend à un compte professionnel avec IBAN français, cartes de paiement et suivi de trésorerie, opéré par Monext et l’informatique d’Arkéa. L’argument tient debout pour un cabinet qui veut équiper son portefeuille sans devenir lui-même plateforme agréée. Côté éditeurs, la marque grise permet d’hériter du statut sans déposer son propre dossier, ce qui évite un chantier de conformité entier.

Les profils pour lesquels le calibrage ne colle pas

Un micro-entrepreneur ou une TPE sans cabinet part avec un handicap : aucun prix affiché, aucun parcours d’inscription autonome documenté, un formulaire de contact comme unique porte d’entrée. Le délai de réponse commerciale devient alors un critère de choix. Autre cas de figure, l’entreprise déjà équipée d’une suite de gestion qui a passé son propre agrément. Quand l’éditeur de votre SIRH ou de votre paie est immatriculé, comme Lucca, ajouter une plateforme supplémentaire alourdit le flux sans rien apporter.

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Conformité, formats et interopérabilité

Le statut ne dit pas tout de la qualité technique d’une plateforme. Ce qui compte, ce sont les certifications tenues, l’endroit où vos données dorment et les formats réellement acceptés. Sur les deux premiers points, Seqino documente. Sur le troisième, nettement moins.

L’essentiel

La liste de la DGFiP recensait 137 plateformes agréées au 2 juillet 2026, dans une version mise à jour le 12 août 2026. Seqino y figure depuis le 15 janvier 2026, pour une durée de trois ans renouvelables.

Certifications, hébergement et souveraineté

L’éditeur revendique trois certifications : NF203, NF525 et ISO 27001. Il se présente comme la seule plateforme agréée à cumuler les deux normes AFNOR de lutte contre la fraude à la TVA. Les données clients sont hébergées chez OVH, à Gravelines, tandis que l’infrastructure de la plateforme agréée tourne sur Outscale, qualifié SecNumCloud. Pour une entreprise soumise à une politique de souveraineté interne, cette chaîne se vérifie et se contractualise sans difficulté.

Formats, annuaire et e-reporting : la zone grise

La communication d’avril 2025 mentionne l’appartenance au réseau Peppol. Les pages produit, en revanche, ne publient ni matrice détaillée des formats acceptés, ni liste des statuts de cycle de vie transmis, ni périmètre exact de l’e-reporting. Trois questions à poser par écrit avant signature : Factur-X, UBL et CII sont-ils gérés en émission comme en réception, quels canaux d’échange existent hors Peppol, et l’e-reporting est-il inclus ou facturé à part.

↪ Bon à savoir

L’annuaire des destinataires reste tenu par le portail public de facturation, jamais par votre plateforme. Un référencement incomplet dans cet annuaire perturbe la réception de vos factures, quelle que soit la qualité de la plateforme retenue.

Limites et points de vigilance

Aucune de ces limites n’est rédhibitoire prise isolément. Ensemble, elles dessinent un profil précis : une plateforme solide sur l’infrastructure, avare en information publique, pensée pour être vendue par un tiers plutôt que choisie en autonomie.

Une opacité tarifaire complète

Rien n’est publié. Les annuaires professionnels reprennent la mention tarif sur demande pour les indépendants, les TPE et les PME. Comparer sans passer par un cycle commercial devient donc impossible. D’autres plateformes agréées font l’inverse : Facnote affiche 120 € HT par an pour cent cinquante factures. Le contraste ne désigne pas la moins chère, il indique surtout le temps que vous perdrez à le savoir.

⚠ Confusion fréquente

Le logiciel de facturation présenté comme gratuit et le service de plateforme agréée ne recouvrent pas la même chose. Le premier crée et envoie vos factures. Le second les transporte, transmet les données à l’administration et engage la conformité. Demandez le périmètre exact couvert par votre contrat, ligne par ligne.

Une distribution indirecte, et peu de retours publics

Le modèle repose sur des prescripteurs. Si votre cabinet ne distribue pas Seqino, votre chemin d’entrée redevient le formulaire de contact. Deuxième point, les annuaires de logiciels ne recensent aucun avis utilisateur sur la solution, ce qui rend la qualité du support invérifiable de l’extérieur. Troisième point, la feuille de route couple facturation, encaissement et compte professionnel. Ce couplage crée de la valeur, il crée aussi une dépendance à mesurer avant de signer.

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Le prix, le délai et la marche à suivre

Deux inconnues restent à lever avant de vous engager : ce que vous paierez, et le temps que vous passerez à brancher la plateforme. La seconde dépend fortement de la brique retenue. Le logiciel en direct et l’API en marque grise n’exigent pas le même effort.

Un modèle sur devis, avec un seul prix affiché

Le seul tarif public de l’éditeur porte sur l’encaissement : 1 % par transaction réglée via le lien de paiement, hors paiements entre comptes Seqino. Tout le reste se négocie. Faites chiffrer sept lignes. Le prix par entreprise ou par dossier, le volume de factures inclus, le coût au dépassement. Puis l’e-reporting, la reprise de l’existant, la durée d’engagement et les conditions de sortie avec export des factures.

Le délai réel de mise en place

Brancher le logiciel en direct relève de la configuration. Passer par l’API demande un chantier complet : intégration REST, tests, recette, puis bascule des flux. Le calendrier ne laisse aucune marge. La réception devient obligatoire pour toutes les entreprises au 1er septembre 2026. L’émission suit à la même date pour les grandes entreprises et les ETI, puis au 1er septembre 2027 pour les PME, les TPE et les micro-entreprises. Une facture non émise sous forme électronique coûte 50 €, dans la limite de 15 000 € par an.

Voici les plateformes vers lesquelles se tournent souvent ceux que Seqino ne couvre pas, avec ce qu’elles publient réellement de leur tarif.

PlateformeCe qu’elle viseTarif public
TiTiimeTPE avec cabinet
Micro et TPE en autonomie Gratuit Voir l’offre
FaFacnoteGrille publiée
Entreprises, cabinets et éditeurs 120 € HT par an Lire la fiche
VcLe Village ConnectéÉcosystème cabinets
Cabinets comptables et leurs clients Sur devis Lire la fiche

Tiime ressort ici pour un profil précis : une micro-entreprise ou une TPE déjà suivie par un cabinet, qui veut une entrée gratuite et immédiate plutôt qu’un devis. Ce terrain n’est pas celui de Seqino, et c’est ce qui justifie la ligne mise en avant. Sur un projet d’intégration par API, la comparaison bascule dans l’autre sens.

À retenir
  • Plateforme agréée immatriculée le 15 janvier 2026, pour trois ans renouvelables.
  • Société créée en 2021, rachetée par le Crédit Mutuel Arkéa en avril 2025.
  • Certifications revendiquées : NF203, NF525 et ISO 27001, hébergement en France.
  • Vente indirecte : cabinets comptables en marque blanche, éditeurs via l’API.
  • Aucune grille tarifaire publique, hors 1 % sur les encaissements par lien.
  • Formats et couverture e-reporting non documentés : à exiger par écrit.
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Questions fréquentes

Peut-on souscrire à Seqino sans passer par un cabinet comptable ?

Rien ne l’interdit, et l’éditeur adresse aussi les entreprises en direct. Le parcours reste néanmoins commercial : le site propose un formulaire de contact et une prise de rendez-vous, sans tarif ni inscription autonome documentée. Comptez donc un échange préalable avant d’obtenir une proposition chiffrée. Pour une structure d’une ou deux personnes, ce délai pèse souvent plus lourd que l’écart de prix.

Seqino remplace-t-il le portail public de facturation ?

Le portail public ne propose plus de service gratuit d’émission et de réception. Il conserve deux rôles : il tient l’annuaire des destinataires et concentre les données destinées à l’administration. Seqino, comme toute plateforme agréée, prend en charge le transport de vos factures et la transmission des données fiscales. Les deux dispositifs fonctionnent ensemble, l’un ne se substitue pas à l’autre.

Que se passerait-il si Seqino perdait son immatriculation ?

L’immatriculation vaut trois ans et se renouvelle auprès de la DGFiP. En cas de retrait ou de non-renouvellement, vous devriez basculer vers une autre plateforme agréée sans interruption, sous peine d’une amende de 500 € après mise en demeure, puis de 1 000 €. Cette hypothèse se prépare au contrat : exigez une clause de réversibilité et un export complet de vos factures dans un format exploitable.

Faut-il avoir choisi sa plateforme avant le 1er septembre 2026 ?

Pour la réception, oui, sans exception : toutes les entreprises doivent être en mesure de recevoir des factures électroniques à cette date. L’émission suit un calendrier étalé, immédiat pour les grandes entreprises et les ETI, reporté au 1er septembre 2027 pour les PME, les TPE et les micro-entreprises. Bonne nouvelle malgré tout, une première infraction régularisée sous trente jours n’est pas sanctionnée.

Comment vérifier soi-même que Seqino est bien immatriculé ?

La liste officielle se télécharge sur impots.gouv.fr, en ODS, XLSX ou PDF, dans une version mise à jour le 12 août 2026. Cherchez l’entrée Seqino : la raison sociale inscrite y est identique au nom commercial, ce qui n’est pas le cas de toutes les plateformes du marché. Refaites la vérification juste avant de signer, la liste évolue à chaque publication.

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