Les deux logiciels figurent dans la même liste officielle de la DGFiP, celle des opérateurs ayant satisfait à toutes les conditions, tests d’interopérabilité inclus. La conformité ne les départage donc plus. Reste un écart brut : 97 € HT par mois chez Axonaut pour un utilisateur, contre 29 € HT par utilisateur chez Sellsy sur la licence Facturation.
Cet écart se referme, puis s’inverse, selon l’effectif et les modules utilisés. Notre comparatif des logiciels de facturation électronique applique la même méthode à d’autres duels. Trois variables décident ici : le nombre d’accès nécessaires, le volume mensuel de factures, et les outils que l’abonnement remplace réellement.
Selon leur combinaison, l’écart va de 68 € par mois en faveur de Sellsy à 23 € par mois en faveur d’Axonaut. Tarifs relevés le 26 juillet 2026 sur les pages officielles des deux éditeurs.
Sellsy facture 29 € HT par utilisateur et par mois, en promotion jusqu’au 31 juillet 2026 et sur la première année seulement, puis 39 €. Axonaut facture 97 € HT par mois pour le premier utilisateur, puis 29,99 € par utilisateur supplémentaire. À dix utilisateurs et hors promotion, Axonaut devient le moins cher.
Le diagnostic classe les plateformes agréées selon votre effectif et votre volume de factures.
Sellsy ou Axonaut : le verdict par situation
Aucune note globale ici, parce qu’une moyenne pondérée masquerait l’essentiel : le gagnant change selon l’usage. Le tableau suivant donne la recommandation situation par situation, avec le motif qui la déclenche.
| Situation | Recommandation | Motif principal |
|---|---|---|
| Facturation seule, une à cinq personnes | Sellsy | Coût par licence nettement inférieur |
| Plus de 100 factures par mois | Axonaut | Aucun plafond d’émission annoncé |
| Remplacer plusieurs logiciels de gestion | Axonaut | Stock, projets, ticketing et RH inclus |
| Équipe commerciale et pipelines structurés | Sellsy | Droits fins et reporting commercial |
| Achats, notes de frais et paiements intégrés | Axonaut | Circuit dépenses complet dans l’abonnement |
| Dix utilisateurs ou plus | À recalculer | Le classement s’inverse hors promotion |
Le nombre d’utilisateurs et les modules réellement ouverts chaque semaine pèsent donc plus que la facturation électronique elle-même dans la décision.
Statut officiel : ce que dit la liste DGFiP au 26 juillet 2026
La DGFiP publie deux listes distinctes. La première recense les opérateurs satisfaisant à l’ensemble des conditions, tests d’interopérabilité en conditions réelles inclus. La seconde regroupe ceux dont le dossier est complet mais qui attendent encore la réussite de ces tests.
Les deux éditeurs sont dans la première liste
Sellsy et Axonaut figurent tous les deux dans la première liste. Le numéro d’immatriculation de Sellsy, dont l’établissement principal est à La Rochelle, a été délivré le 24 décembre 2025. Celui d’Axonaut, établi à Balma, date du 8 janvier 2026. Le statut réglementaire ne permet donc plus de les départager.
La liste évolue chaque semaine, et un éditeur peut y entrer ou changer de catégorie. Consultez la liste officielle des plateformes agréées avant de signer, plutôt qu’une reprise datée, y compris la nôtre.
Ce que l’immatriculation ne garantit pas
L’immatriculation valide la conformité fiscale, la sécurité des infrastructures et l’interopérabilité technique. Elle ne dit rien de la lisibilité d’un rejet, du délai de support sur une facture bloquée, ni des conditions de récupération de dix ans d’archives après résiliation.
Chez Sellsy, le déploiement passe par un pilote officiel de la DGFiP, ouvert sur la base du volontariat. Tous les comptes n’y ont donc pas encore accès. L’éditeur précise par ailleurs que l’e-reporting reste temporairement indisponible pendant cette phase pilote, une facture émise dans ce mode étant traitée sans transmission à l’administration.
Le défaut de transmission conforme d’une facture expose à une amende de 15 € par facture, plafonnée à 15 000 € par année civile. L’entreprise qui n’a désigné aucune plateforme de réception relève d’un régime distinct, prévu à l’article 1737 IV bis du CGI : mise en demeure, puis 500 € si le manquement persiste trois mois plus tard, puis 1 000 € après chaque nouvelle période de trois mois. La première infraction régularisée spontanément n’est pas sanctionnée.
La chaîne réglementaire, ligne par ligne
Les mentions « non documenté » ci-dessous signalent une absence d’information publique, pas une absence de fonction. Elles indiquent les questions à poser en démonstration.
| Critère réglementaire | Sellsy | Axonaut |
|---|---|---|
| Statut sur la liste DGFiP | Conditions remplies, tests inclus | Conditions remplies, tests inclus |
| Réception des factures fournisseurs | Module Achats inclus | Incluse dans l’abonnement |
| Émission réglementaire | Licence Facturation | Incluse dans l’abonnement |
| Mise à jour de l’annuaire | Parcours guidé documenté | À confirmer auprès de l’éditeur |
| Plusieurs adresses de réception | Documenté, suffixe par établissement | Non documenté publiquement |
| Statuts du cycle de vie | Cinq statuts documentés côté acheteur | Non détaillé publiquement |
| Profils Factur-X émis | Non publié | Non publié |
| Coût de la plateforme agréée | Inclus dans la licence | Inclus, sans surcoût annoncé |
Sellsy a publié en juillet 2026 un guide consacré aux statuts dans son pilote, avec les actions disponibles côté acheteur. La documentation d’Axonaut reste moins précise sur la remontée des rejets et des changements de statut dans l’interface. Cette asymétrie documentaire ne prouve rien sur la fonction elle-même, elle oblige à la faire démontrer.
Sur les formats, aucun des deux n’indique publiquement quel profil Factur-X il émet. Un profil dépourvu du détail structuré des lignes limite fortement les rapprochements par produit, commande ou bon de livraison. Un rapprochement global reste possible à partir de l’en-tête et des totaux. La question mérite donc une réponse écrite avant signature.
Prix réels : la comparaison que les fiches produit simplifient
Les deux éditeurs affichent des prix d’appel qui ne recouvrent ni le même périmètre, ni la même unité de facturation, ni la même durée. Voici ce que recouvre chaque montant.
Combien coûte réellement Sellsy
La licence Facturation en paiement annuel affiche 29 € HT par utilisateur et par mois en Standard, soit 348 € par an, contre 39 € en tarif barré. Evolution passe à 49 € et Elite à 79 €. En paiement mensuel, comptez 35 €, 59 € et 95 €. La remise relève d’une offre Réforme Facturation Électronique, valable jusqu’au 31 juillet 2026 et limitée à la première année.
La licence Vente se facture séparément. La formule combinée Vente et Facturation démarre à 39 € par utilisateur en promotion, contre 49 € hors promotion, avec un minimum de deux utilisateurs affiché sur la page tarifaire. Le module Trésorerie s’ajoute à 49 € HT par mois en Standard, cette fois sans multiplication par utilisateur.
Le tarif de 3,90 € HT par mois mis en avant sur le site de Sellsy ne concerne pas la suite Sellsy. Il correspond à TeamSystem Facture, une solution distincte poussée vers les indépendants. Un comparatif qui écrit « Sellsy dès 3,90 € » compare deux produits différents.
Combien coûte réellement Axonaut
Le seul montant directement comparable sans hypothèse est le tarif mensuel sans engagement : 97 € HT pour le premier utilisateur, puis 29,99 € HT par utilisateur supplémentaire. La page affiche par ailleurs un prix d’appel « dès 38 € », qui correspond à un abonnement prépayé sur longue durée.
Le support de l’éditeur annonce 10 % de réduction minimum sur un an et 20 % sur deux ans. D’autres pages affichent des remises supérieures selon la durée. Les niveaux publiés n’étant pas homogènes, relevez le prix prépayé dans le simulateur du compte d’essai ou demandez un devis daté correspondant à votre nombre exact d’utilisateurs.
Le « tout inclus » connaît quelques exceptions assumées. Axonaut facture 1 € par signature électronique effective et 2 € par mois pour chaque compte bancaire externe connecté au-delà du premier. Les SMS, les courriers postaux et les campagnes d’emailing s’ajoutent également, à raison de 0,05 € par tranche de 20 destinataires. Les commissions de Stripe, GoCardless ou PayPal restent à leur charge habituelle.
Le coût comparé par taille d’équipe
Le scénario ci-dessous isole la facturation seule, sans CRM avancé ni trésorerie. Il compare la licence Sellsy Facturation Standard en paiement annuel promotionnel à l’abonnement Axonaut sans engagement, en euros hors taxes par mois.
| Plateforme | 1 utilisateur | 5 utilisateurs | 10 utilisateurs | |
|---|---|---|---|---|
SeSellsyLicence Facturation | 29 € | 145 € | 290 € | Lire la fiche |
| 97 € | 216,96 € | 366,91 € | Voir l’offre |
Refaites le calcul au tarif Sellsy hors promotion, soit 39 € par utilisateur. À dix utilisateurs, Sellsy passe à 390 € par mois, contre 366,91 € chez Axonaut. Le classement s’inverse, et il s’inverse en incluant chez Axonaut le CRM, le stock, les projets, le ticketing et le compte de paiement.
Sur trois ans avec cinq utilisateurs, Sellsy Facturation Standard revient à 6 420 € : 1 740 € la première année, puis 2 340 € les deux suivantes. Axonaut sans remise atteint 7 810,56 €, soit 216,96 € multipliés par 36 mois. Pour les formules prépayées, nous n’affichons pas de coût pluriannuel remisé faute de simulation contractuelle correspondant exactement à cet effectif. Notre page sur les prix des plateformes agréées replace ces montants dans le marché.
Factures de vente : quotas, encaissement et impayés
Sur la création de documents, les deux couvrent l’essentiel du cycle commercial français : acomptes, soldes, avoirs, multi-devises, multi-langues et factures récurrentes. La différence tient aux plafonds posés sur chaque fonction.
Le plafond de 100 factures mensuelles
Sellsy limite la création de factures à 100 par mois en Standard et 300 en Evolution. L’illimité arrive en Elite, à 79 € par utilisateur. Les abonnements récurrents suivent la même logique, avec 20 actifs en Standard, 200 en Evolution et l’illimité en Elite. Le catalogue plafonne à 300 références en Standard.
Axonaut annonce des devis et des factures en nombre illimité, sans palier. Pour un e-commerçant, un organisme de formation ou une société de maintenance, ce seul point peut décider du choix. Cent factures mensuelles représentent cinq documents par jour ouvré.
Paiement et recouvrement
Sellsy s’appuie sur Stripe, PayPal et Atos pour le paiement en ligne, sur GoCardless pour le prélèvement SEPA. Les plans de relance sont illimités dès le Standard, mais le rapprochement bancaire se limite à une banque, trois en Evolution. Une entreprise multibancaire monte donc de plan pour une raison technique.
Axonaut couvre les mêmes prestataires, ajoute la relance automatique des devis et va jusqu’au recouvrement par huissiers. La récupération des lignes bancaires et la suggestion des rapprochements sont incluses sans palier. Sur les impayés, l’avantage penche nettement de ce côté.
Factures fournisseurs : la partie que la majorité des comparatifs oublie
Recevoir une facture et la traiter sont deux opérations distinctes. La réforme impose la première dès septembre 2026. La seconde reste un travail comptable, que l’outil facilite ou complique.
Le module Achats de Sellsy
Le module Achats est compris dans la licence Facturation, sans supplément. Une fois Sellsy désignée comme plateforme de réception via le mandat, les factures fournisseurs arrivent dans cet espace. L’édition et le scan des achats figurent dans les trois plans, avec le suivi des marges par document.
Sellsy précise un point utile pour les acheteurs internationaux : les factures de fournisseurs étrangers ou non assujettis continueront d’arriver par email, mais devront être intégrées à l’outil pour alimenter l’e-reporting. Le flux ne change pas, l’obligation déclarative si.
La gestion des dépenses chez Axonaut
Axonaut inclut la saisie automatique des dépenses par reconnaissance optique, les commandes fournisseurs, les bons de commande, les notes de frais avec indemnités kilométriques et le paiement des fournisseurs. La récupération automatique des lignes bancaires complète le circuit. Le périmètre couvert dépasse celui de Sellsy sur ce poste.
La question qui départage
Posez-la aux deux commerciaux dans les mêmes termes : le logiciel se contente-t-il de recevoir la facture, ou aide-t-il à la contrôler, la valider, l’imputer, la payer et l’envoyer au comptable ? L’agrément ne garantit que le premier maillon.
Chiffrez ensuite le reste sur votre propre volume. Une entreprise traitant 500 factures fournisseurs par an économise 16 h 40 si l’outil fait gagner deux minutes par pièce. À un coût interne de 35 € de l’heure, le gain atteint environ 583 € par an. Remplacez ces trois paramètres par les vôtres avant de conclure.
Comptabilité et collaboration avec le cabinet
Les deux éditeurs offrent un accès gratuit à l’expert-comptable, dès le premier plan chez Sellsy. La différence se joue sur la profondeur des connecteurs et sur leur usage réel par le cabinet.
Exports et connecteurs
Sellsy propose un plan comptable personnalisable, des journaux de gestion, une balance âgée et l’export FEC ou CSV dans les trois plans. L’éditeur annonce des intégrations avec Sage 100, Sage Génération Experts, ACD, MyUnisoft, Cegid Loop, Tiime, Fulll et Inexweb. Axonaut automatise les journaux, calcule la déclaration de TVA, gère l’autoliquidation et annonce Sage, MyUnisoft, Pennylane, Tiime, ACD et Inqom.
Avant de choisir, demandez à votre expert-comptable laquelle des deux connexions il utilise réellement. Une intégration présente sur une marketplace ne garantit ni son activation, ni sa maîtrise par le cabinet, ni son caractère bidirectionnel.
Pré-comptabilité et limites assumées
Sellsy documente lui-même la nuance : les codes tiers sont générés et transmis, sans grand livre auxiliaire dans l’outil, et le suivi analytique fonctionne par affaire ou produit, sans plan multi-axes. Si votre cabinet impose son environnement, la question du duel se déplace entièrement. Sur ce terrain, notre page Indy ou Pennylane traite des solutions bâties d’abord pour la production comptable.
Quel choix selon votre profil
Les recommandations ci-dessous supposent un besoin réel, pas un besoin déclaré. Payer pour un module de stock inutilisé revient au même que payer une licence surdimensionnée.
Indépendant et très petite structure
À 97 € par mois pour un seul utilisateur, Axonaut est surdimensionné si le CRM, le stock et les projets restent inutilisés. Sellsy à 29 € reste plus rationnel. La comparaison pertinente se situe souvent ailleurs encore, du côté des offres à moins de 20 € par mois, voire gratuites pour la seule réception.
TPE, agence et négoce
Comptez d’abord combien de personnes ont réellement besoin d’un accès. Un seul utilisateur administratif ramène la facture Sellsy à 29 €. Une agence facturant au temps passé trouvera chez Axonaut les feuilles de temps et la marge par projet. Un négoce y trouvera le stock, les bons de livraison et les commandes fournisseurs. Pour un besoin de gestion très large à budget contraint, comparez aussi Odoo ou Dolibarr.
PME avec équipe commerciale
Sellsy sépare finement les droits : 2 profils en Standard et 5 en Evolution sur une licence simple, 3 et 10 sur la formule Vente et Facturation, illimités en Elite. Les pipelines passent de 2 à 20, puis à l’illimité. Les quotas API vont de 50 000 à 432 000 requêtes par jour sur les licences simples, et jusqu’à 250 000 puis 432 000 sur la formule combinée.
Le compte de paiement Axonaut, à vérifier avant de compter dessus
Le Compte Pro et ses cartes sont annoncés sans frais de tenue, de mouvement ni de gestion pour les abonnés. Il s’agit d’un compte de paiement opéré avec Swan, établissement de monnaie électronique agréé par l’ACPR, sans découvert autorisé. Il ne remplace donc pas une banque qui finance l’entreprise, sujet traité dans tout savoir sur Qonto ou Shine.
Point important pour les entreprises ultramarines : l’ouverture est réservée aux sociétés domiciliées en France métropolitaine, avec une résidence fiscale française. Plusieurs secteurs sont par ailleurs exclus, dont les jeux, les cryptomonnaies, les pierres précieuses et la domiciliation. Vérifiez votre code APE avant d’intégrer ce compte dans votre calcul d’économies.
Migration : ce qui se passe si vous changez d’outil
Deux migrations coexistent, et elles n’obéissent pas aux mêmes règles. Les confondre fait perdre plusieurs semaines dans un calendrier déjà tendu.
La portabilité réglementaire est simple
Changer de plateforme agréée repose sur l’annuaire tenu par l’administration. Vous signez un mandat avec la nouvelle plateforme, qui met à jour votre adresse. L’ancienne désactive l’adressage et reste tenue de transmettre pendant douze mois les informations reçues sur l’ancienne adresse, statuts compris. Vos fournisseurs n’ont rien à reconfigurer, comme le détaille notre guide sur comment changer de plateforme agréée.
La migration des données est une autre affaire
Clients, fournisseurs, catalogue, factures historiques, pièces jointes, numérotation, abonnements actifs et mandats de prélèvement ne passent pas par l’annuaire. Sellsy réserve à l’offre Elite la prestation d’import initial réalisée par ses équipes, dans la limite de 5 000 lignes. Cette prestation d’accompagnement se distingue des imports que l’utilisateur réalise lui-même, disponibles sur les autres plans.
Demandez par écrit, avant de signer, sous quel format et dans quel délai vous récupérerez l’intégralité de vos données après résiliation. La question paraît prématurée le jour de la souscription. Elle devient centrale le jour de la sortie, avec dix ans d’archivage à assurer.
Méthodologie et limites de ce comparatif
Ce comparatif distingue trois niveaux de preuve. Les éléments vérifiés proviennent des documentations officielles et de la liste DGFiP, consultées le 26 juillet 2026. Les éléments indiqués par l’éditeur sont repris comme tels, sans validation indépendante. Les points non documentés publiquement sont signalés comme tels plutôt que remplis par une coche.
Ce que nous n’avons pas testé
Le traitement d’un rejet, la remontée des statuts et l’automatisation de l’e-reporting n’ont pas été éprouvés en conditions réelles. Nous déconseillons d’émettre une facture fictive vers un destinataire erroné sur un environnement raccordé au flux réglementaire. Demandez plutôt une démonstration du traitement d’un rejet dans l’environnement pilote ou sur un compte de test : erreur de destinataire, données obligatoires manquantes, refus par l’acheteur et correction de la facture.
Transparence sur les liens
Certains liens de ce comparatif sont affiliés. Cette rémunération n’influence ni les critères étudiés, ni les recommandations. Les tarifs et fonctions proviennent des documentations officielles des éditeurs, et les éléments non vérifiés sont signalés comme tels dans le texte.
Les tarifs des deux éditeurs évoluent, la promotion Sellsy expire le 31 juillet 2026 et la liste DGFiP change chaque semaine. Revérifiez ces trois points le jour de votre décision.
- Sellsy et Axonaut figurent dans la première liste DGFiP, tests d’interopérabilité inclus, avec des numéros délivrés les 24 décembre 2025 et 8 janvier 2026.
- Sellsy Facturation : 29 € HT par utilisateur en promotion jusqu’au 31 juillet 2026, puis 39 €.
- Axonaut : 97 € HT par mois pour un utilisateur, puis 29,99 € par utilisateur supplémentaire.
- Sellsy plafonne à 100 factures mensuelles en Standard et 300 en Evolution ; Axonaut annonce l’illimité.
- À dix utilisateurs et hors promotion, Axonaut devient moins cher que Sellsy.
- Réception obligatoire pour toutes les entreprises au 1er septembre 2026, émission des PME au 1er septembre 2027.
- Le Compte Pro Axonaut est réservé aux entreprises domiciliées en France métropolitaine.
Trois questions sur votre effectif, votre volume et vos modules suffisent à trancher.
Questions fréquentes
Le tarif Sellsy à 3,90 € correspond-il à la suite Sellsy ?
Non. Ces 3,90 € HT par mois désignent TeamSystem Facture, une solution distincte mise en avant auprès des indépendants. La suite Sellsy démarre à 29 € HT par utilisateur et par mois sur la licence Facturation, en paiement annuel promotionnel. Les deux produits ne partagent ni le même périmètre, ni la même interface.
Que se passe-t-il si je dépasse 100 factures par mois chez Sellsy ?
Le plan Standard limite la création de factures à 100 par mois. Un dépassement régulier impose le passage en Evolution, à 300 factures, ou en Elite pour l’illimité. Vérifiez ce point sur votre pic saisonnier plutôt que sur votre moyenne annuelle, un seul mois chargé suffisant à déclencher la montée de plan.
Faut-il deux licences Sellsy pour avoir le CRM et la facturation ?
Sellsy commercialise une licence Vente et Facturation qui réunit les deux périmètres, affichée à partir de 39 € HT par utilisateur en promotion et 49 € hors promotion. La page tarifaire mentionne un minimum de deux utilisateurs sur cette formule. Prendre séparément les deux licences revient plus cher, sans avantage fonctionnel.
Le Compte Pro Axonaut remplace-t-il une banque professionnelle ?
Il fournit un IBAN français, la tenue de compte, les virements, les prélèvements SEPA et des cartes Mastercard, sans frais de tenue, de mouvement ni de gestion pour les abonnés. Il s’agit d’un compte de paiement opéré avec Swan, sans découvert autorisé, dont les fonds sont ségrégués et couverts jusqu’à 100 000 €. Il complète une banque plutôt qu’il ne la remplace, notamment si vous avez des crédits en cours.
Peut-on tester les deux gratuitement ?
Axonaut propose un essai gratuit de 15 jours sans engagement, ouvrant toutes les fonctionnalités. Sellsy oriente principalement vers une demande de démonstration, avec un accès d’essai disponible sur son parcours d’inscription. Testez les deux sur le même jeu de données : cinq clients, trois fournisseurs, un avoir partiel et un export comptable.
Peut-on changer de plateforme agréée après septembre 2026 ?
Oui. Le changement repose sur un mandat signé avec la nouvelle plateforme, qui met à jour l’annuaire. L’ancienne doit transmettre pendant douze mois les informations reçues sur l’ancienne adresse. Cette portabilité concerne l’adressage réglementaire, pas la reprise de vos données commerciales, qui reste une opération distincte à négocier.
La facturation électronique coûte-t-elle un supplément chez l’un des deux ?
Aucun des deux n’annonce de ligne supplémentaire pour la plateforme agréée. Chez Sellsy, l’émission relève de la licence Facturation et la réception du module Achats, inclus dans cette licence. Chez Axonaut, la plateforme est comprise dans l’abonnement. Faites confirmer par écrit si ce principe restera valable après septembre 2027.
Lequel choisir si mon expert-comptable impose son logiciel ?
Les deux annoncent des connecteurs vers Sage, MyUnisoft, ACD et Tiime. Sellsy ajoute Cegid Loop, Fulll et Inexweb, Axonaut ajoute Pennylane et Inqom. Faites confirmer par votre cabinet quelle connexion il exploite en production et si elle fonctionne dans les deux sens, avant de trancher sur ce seul critère.